La organización social tradicional era la de los grupos pequeños del tipo banda nómada, de cazadores-recolectores, basada en la agrupación de la familia extensa consanguínea. Había entre los Yuqui un sistema de estratificación social de amos y esclavos, o por herencia u orfandad.
La organización social se basa actualmente en la familia nuclear, bajo el modelo y la influencia de los misioneros evangelistas.